Zasłużony duszpasterz Parafii Ewangelickiej i obywatel Sopotu.
Urodził się w Morągu. Studia teologiczne odbył na Uniwersytecie w Królewcu, gdzie w 1889 roku został ordynowany i wprowadzony w urząd duchownego. Stanowisko proboszcza parafii sopockiej objął w roku 1901. W czasie swojej służby dokończył budowę największego kościoła ewangelickiego w Sopocie, który po II wojnie światowej stał się kościołem rzymskokatolickim św. Jerzego. W latach 1914–1919 z inicjatywy ks. Otto Bowiena został wybudowany drugi kościół ewangelicki, kościół Pokoju, później przemianowany na kościół Zbawiciela. Służy on do dziś i jest jedynym kościołem ewangelickim w Trójmieście.
Ks. Otto Bowien również znacząco zasłużył się dla Miasta i wpłynął na jego rozwój. Założył przedszkole oraz szkołę, wybudował trzy zakłady opieki, był krzewicielem oświaty, inicjatorem powołania wielu stowarzyszeń społecznych. Jako ekumenista utrzymywał kontakt z lokalną społecznością rzymskokatolicką i żydowską. Swoją służbę duszpasterską pełnił ponad 30 lat. Odszedł nagle w październiku 1931 r., wracając z Gdańska z konferencji teologicznej.
Postać ks. Otto Bowiena uhonorowano w 2001 r. – od 10 czerwca tego roku jego imię nosi skwer przy ewangelickim kościele Zbawiciela w Sopocie.